Protein–RNA interactions for Protein: O75631

UPK3A, Uroplakin-3a, humanhuman

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3AO75631 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
UPK3AO75631 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
UPK3AO75631 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
UPK3AO75631 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
UPK3AO75631 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
UPK3AO75631 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
UPK3AO75631 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
UPK3AO75631 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
UPK3AO75631 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
UPK3AO75631 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
UPK3AO75631 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
UPK3AO75631 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
UPK3AO75631 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
UPK3AO75631 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
UPK3AO75631 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
UPK3AO75631 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
UPK3AO75631 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
UPK3AO75631 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
UPK3AO75631 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
UPK3AO75631 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
UPK3AO75631 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
UPK3AO75631 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
UPK3AO75631 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
UPK3AO75631 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
UPK3AO75631 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
UPK3AO75631 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
UPK3AO75631 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
UPK3AO75631 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
UPK3AO75631 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
UPK3AO75631 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
UPK3AO75631 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
UPK3AO75631 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
UPK3AO75631 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
UPK3AO75631 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
UPK3AO75631 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
UPK3AO75631 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
UPK3AO75631 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
UPK3AO75631 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
UPK3AO75631 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
UPK3AO75631 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
UPK3AO75631 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
UPK3AO75631 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
UPK3AO75631 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
UPK3AO75631 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
UPK3AO75631 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
UPK3AO75631 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
UPK3AO75631 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
UPK3AO75631 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
UPK3AO75631 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
UPK3AO75631 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
UPK3AO75631 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
UPK3AO75631 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
UPK3AO75631 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
UPK3AO75631 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
UPK3AO75631 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
UPK3AO75631 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
UPK3AO75631 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
UPK3AO75631 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
UPK3AO75631 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
UPK3AO75631 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
UPK3AO75631 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
UPK3AO75631 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
UPK3AO75631 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
UPK3AO75631 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
UPK3AO75631 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
UPK3AO75631 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
UPK3AO75631 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
UPK3AO75631 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
UPK3AO75631 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
UPK3AO75631 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
UPK3AO75631 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
UPK3AO75631 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
UPK3AO75631 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
UPK3AO75631 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
UPK3AO75631 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
UPK3AO75631 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
UPK3AO75631 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
UPK3AO75631 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
UPK3AO75631 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
UPK3AO75631 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
UPK3AO75631 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
UPK3AO75631 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
UPK3AO75631 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
UPK3AO75631 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UPK3AO75631 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
UPK3AO75631 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
UPK3AO75631 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
UPK3AO75631 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
UPK3AO75631 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
UPK3AO75631 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UPK3AO75631 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
UPK3AO75631 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
UPK3AO75631 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
UPK3AO75631 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
UPK3AO75631 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
UPK3AO75631 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
UPK3AO75631 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
UPK3AO75631 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
UPK3AO75631 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
UPK3AO75631 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms