Protein–RNA interactions for Protein: O75508

CLDN11, Claudin-11, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN11O75508 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC35.28■■■■□ 3.24
CLDN11O75508 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CLDN11O75508 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CLDN11O75508 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
CLDN11O75508 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
CLDN11O75508 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CLDN11O75508 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CLDN11O75508 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
CLDN11O75508 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CLDN11O75508 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CLDN11O75508 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CLDN11O75508 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CLDN11O75508 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
CLDN11O75508 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
CLDN11O75508 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
CLDN11O75508 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
CLDN11O75508 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CLDN11O75508 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CLDN11O75508 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CLDN11O75508 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
CLDN11O75508 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.77
CLDN11O75508 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CLDN11O75508 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
CLDN11O75508 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
CLDN11O75508 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
CLDN11O75508 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
CLDN11O75508 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
CLDN11O75508 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
CLDN11O75508 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CLDN11O75508 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CLDN11O75508 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
CLDN11O75508 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CLDN11O75508 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CLDN11O75508 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CLDN11O75508 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CLDN11O75508 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
CLDN11O75508 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
CLDN11O75508 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
CLDN11O75508 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
CLDN11O75508 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CLDN11O75508 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CLDN11O75508 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
CLDN11O75508 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CLDN11O75508 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CLDN11O75508 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CLDN11O75508 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CLDN11O75508 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
CLDN11O75508 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CLDN11O75508 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CLDN11O75508 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CLDN11O75508 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CLDN11O75508 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CLDN11O75508 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CLDN11O75508 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CLDN11O75508 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CLDN11O75508 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CLDN11O75508 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
CLDN11O75508 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
CLDN11O75508 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CLDN11O75508 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
CLDN11O75508 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CLDN11O75508 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CLDN11O75508 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CLDN11O75508 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CLDN11O75508 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CLDN11O75508 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CLDN11O75508 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CLDN11O75508 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CLDN11O75508 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CLDN11O75508 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CLDN11O75508 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CLDN11O75508 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CLDN11O75508 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CLDN11O75508 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CLDN11O75508 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CLDN11O75508 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CLDN11O75508 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CLDN11O75508 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CLDN11O75508 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CLDN11O75508 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CLDN11O75508 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CLDN11O75508 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CLDN11O75508 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CLDN11O75508 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CLDN11O75508 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CLDN11O75508 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CLDN11O75508 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CLDN11O75508 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CLDN11O75508 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CLDN11O75508 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CLDN11O75508 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CLDN11O75508 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
CLDN11O75508 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CLDN11O75508 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CLDN11O75508 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CLDN11O75508 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CLDN11O75508 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CLDN11O75508 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CLDN11O75508 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CLDN11O75508 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms