Protein–RNA interactions for Protein: O75170

PPP6R2, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP6R2O75170 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
PPP6R2O75170 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC38.32■■■■□ 3.72
PPP6R2O75170 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC37.72■■■■□ 3.63
PPP6R2O75170 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
PPP6R2O75170 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
PPP6R2O75170 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.6
PPP6R2O75170 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
PPP6R2O75170 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
PPP6R2O75170 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
PPP6R2O75170 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
PPP6R2O75170 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC36.76■■■■□ 3.48
PPP6R2O75170 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
PPP6R2O75170 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
PPP6R2O75170 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.37
PPP6R2O75170 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
PPP6R2O75170 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
PPP6R2O75170 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
PPP6R2O75170 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
PPP6R2O75170 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
PPP6R2O75170 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
PPP6R2O75170 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
PPP6R2O75170 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
PPP6R2O75170 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.29■■■■□ 3.24
PPP6R2O75170 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
PPP6R2O75170 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC35.25■■■■□ 3.23
PPP6R2O75170 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
PPP6R2O75170 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
PPP6R2O75170 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
PPP6R2O75170 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
PPP6R2O75170 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
PPP6R2O75170 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
PPP6R2O75170 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
PPP6R2O75170 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
PPP6R2O75170 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
PPP6R2O75170 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
PPP6R2O75170 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
PPP6R2O75170 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
PPP6R2O75170 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
PPP6R2O75170 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
PPP6R2O75170 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
PPP6R2O75170 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
PPP6R2O75170 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
PPP6R2O75170 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
PPP6R2O75170 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
PPP6R2O75170 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
PPP6R2O75170 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
PPP6R2O75170 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
PPP6R2O75170 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
PPP6R2O75170 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
PPP6R2O75170 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
PPP6R2O75170 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PPP6R2O75170 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PPP6R2O75170 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
PPP6R2O75170 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
PPP6R2O75170 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
PPP6R2O75170 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
PPP6R2O75170 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PPP6R2O75170 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PPP6R2O75170 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PPP6R2O75170 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PPP6R2O75170 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PPP6R2O75170 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PPP6R2O75170 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PPP6R2O75170 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PPP6R2O75170 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
PPP6R2O75170 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PPP6R2O75170 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
PPP6R2O75170 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
PPP6R2O75170 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
PPP6R2O75170 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
PPP6R2O75170 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
PPP6R2O75170 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
PPP6R2O75170 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
PPP6R2O75170 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
PPP6R2O75170 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
PPP6R2O75170 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PPP6R2O75170 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
PPP6R2O75170 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
PPP6R2O75170 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
PPP6R2O75170 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
PPP6R2O75170 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
PPP6R2O75170 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
PPP6R2O75170 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
PPP6R2O75170 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
PPP6R2O75170 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
PPP6R2O75170 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
PPP6R2O75170 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC33.08■■■□□ 2.89
PPP6R2O75170 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
PPP6R2O75170 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PPP6R2O75170 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
PPP6R2O75170 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC32.98■■■□□ 2.87
PPP6R2O75170 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
PPP6R2O75170 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
PPP6R2O75170 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
PPP6R2O75170 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
PPP6R2O75170 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
PPP6R2O75170 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
PPP6R2O75170 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
PPP6R2O75170 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
PPP6R2O75170 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms