Protein–RNA interactions for Protein: O15060

ZBTB39, Zinc finger and BTB domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBTB39O15060 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC38.36■■■■□ 3.73
ZBTB39O15060 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.62
ZBTB39O15060 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
ZBTB39O15060 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC37.24■■■■□ 3.55
ZBTB39O15060 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
ZBTB39O15060 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
ZBTB39O15060 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC36.87■■■■□ 3.49
ZBTB39O15060 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
ZBTB39O15060 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
ZBTB39O15060 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.22■■■■□ 3.39
ZBTB39O15060 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
ZBTB39O15060 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
ZBTB39O15060 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
ZBTB39O15060 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
ZBTB39O15060 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
ZBTB39O15060 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
ZBTB39O15060 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
ZBTB39O15060 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC35.4■■■■□ 3.26
ZBTB39O15060 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
ZBTB39O15060 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
ZBTB39O15060 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
ZBTB39O15060 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
ZBTB39O15060 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
ZBTB39O15060 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
ZBTB39O15060 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
ZBTB39O15060 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC34.56■■■■□ 3.12
ZBTB39O15060 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
ZBTB39O15060 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
ZBTB39O15060 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
ZBTB39O15060 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
ZBTB39O15060 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
ZBTB39O15060 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
ZBTB39O15060 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
ZBTB39O15060 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
ZBTB39O15060 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
ZBTB39O15060 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
ZBTB39O15060 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
ZBTB39O15060 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
ZBTB39O15060 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
ZBTB39O15060 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
ZBTB39O15060 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
ZBTB39O15060 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
ZBTB39O15060 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
ZBTB39O15060 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
ZBTB39O15060 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
ZBTB39O15060 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
ZBTB39O15060 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
ZBTB39O15060 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC33.77■■■■□ 3
ZBTB39O15060 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
ZBTB39O15060 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
ZBTB39O15060 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
ZBTB39O15060 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
ZBTB39O15060 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
ZBTB39O15060 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
ZBTB39O15060 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
ZBTB39O15060 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
ZBTB39O15060 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
ZBTB39O15060 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
ZBTB39O15060 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
ZBTB39O15060 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
ZBTB39O15060 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
ZBTB39O15060 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
ZBTB39O15060 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
ZBTB39O15060 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
ZBTB39O15060 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC33.05■■■□□ 2.88
ZBTB39O15060 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
ZBTB39O15060 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
ZBTB39O15060 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
ZBTB39O15060 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
ZBTB39O15060 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
ZBTB39O15060 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
ZBTB39O15060 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
ZBTB39O15060 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
ZBTB39O15060 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.93■■■□□ 2.86
ZBTB39O15060 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
ZBTB39O15060 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
ZBTB39O15060 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
ZBTB39O15060 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
ZBTB39O15060 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
ZBTB39O15060 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
ZBTB39O15060 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
ZBTB39O15060 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
ZBTB39O15060 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
ZBTB39O15060 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
ZBTB39O15060 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
ZBTB39O15060 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
ZBTB39O15060 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
ZBTB39O15060 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
ZBTB39O15060 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
ZBTB39O15060 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
ZBTB39O15060 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
ZBTB39O15060 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
ZBTB39O15060 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
ZBTB39O15060 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
ZBTB39O15060 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
ZBTB39O15060 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
ZBTB39O15060 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
ZBTB39O15060 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
ZBTB39O15060 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
ZBTB39O15060 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms