Protein–RNA interactions for Protein: O14966

RAB29, Ras-related protein Rab-7L1, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB29O14966 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RAB29O14966 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■■□□ 2
RAB29O14966 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
RAB29O14966 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RAB29O14966 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RAB29O14966 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RAB29O14966 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RAB29O14966 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAB29O14966 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAB29O14966 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAB29O14966 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RAB29O14966 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAB29O14966 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RAB29O14966 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAB29O14966 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAB29O14966 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RAB29O14966 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAB29O14966 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RAB29O14966 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RAB29O14966 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAB29O14966 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAB29O14966 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAB29O14966 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAB29O14966 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RAB29O14966 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RAB29O14966 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RAB29O14966 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB29O14966 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB29O14966 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB29O14966 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB29O14966 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAB29O14966 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAB29O14966 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAB29O14966 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAB29O14966 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAB29O14966 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAB29O14966 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RAB29O14966 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAB29O14966 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB29O14966 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB29O14966 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB29O14966 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB29O14966 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB29O14966 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB29O14966 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB29O14966 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB29O14966 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB29O14966 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB29O14966 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB29O14966 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB29O14966 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB29O14966 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB29O14966 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB29O14966 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB29O14966 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB29O14966 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB29O14966 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RAB29O14966 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB29O14966 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB29O14966 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB29O14966 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB29O14966 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB29O14966 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB29O14966 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB29O14966 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB29O14966 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB29O14966 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB29O14966 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB29O14966 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB29O14966 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB29O14966 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB29O14966 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB29O14966 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB29O14966 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB29O14966 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RAB29O14966 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB29O14966 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB29O14966 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB29O14966 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RAB29O14966 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RAB29O14966 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RAB29O14966 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB29O14966 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB29O14966 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB29O14966 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
RAB29O14966 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB29O14966 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB29O14966 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RAB29O14966 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB29O14966 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB29O14966 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB29O14966 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB29O14966 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB29O14966 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RAB29O14966 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RAB29O14966 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB29O14966 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB29O14966 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB29O14966 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB29O14966 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms