Protein–RNA interactions for Protein: O14827

RASGRF2, Ras-specific guanine nucleotide-releasing factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRF2O14827 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC34.12■■■■□ 3.05
RASGRF2O14827 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
RASGRF2O14827 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
RASGRF2O14827 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
RASGRF2O14827 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
RASGRF2O14827 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC33.19■■■□□ 2.9
RASGRF2O14827 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
RASGRF2O14827 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
RASGRF2O14827 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
RASGRF2O14827 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.88■■■□□ 2.85
RASGRF2O14827 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
RASGRF2O14827 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
RASGRF2O14827 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
RASGRF2O14827 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
RASGRF2O14827 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
RASGRF2O14827 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
RASGRF2O14827 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
RASGRF2O14827 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
RASGRF2O14827 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
RASGRF2O14827 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
RASGRF2O14827 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
RASGRF2O14827 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
RASGRF2O14827 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
RASGRF2O14827 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC31.89■■■□□ 2.7
RASGRF2O14827 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
RASGRF2O14827 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
RASGRF2O14827 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
RASGRF2O14827 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
RASGRF2O14827 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
RASGRF2O14827 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
RASGRF2O14827 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
RASGRF2O14827 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
RASGRF2O14827 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
RASGRF2O14827 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
RASGRF2O14827 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
RASGRF2O14827 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
RASGRF2O14827 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
RASGRF2O14827 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
RASGRF2O14827 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
RASGRF2O14827 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
RASGRF2O14827 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
RASGRF2O14827 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
RASGRF2O14827 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
RASGRF2O14827 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
RASGRF2O14827 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
RASGRF2O14827 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
RASGRF2O14827 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
RASGRF2O14827 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
RASGRF2O14827 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
RASGRF2O14827 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
RASGRF2O14827 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
RASGRF2O14827 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
RASGRF2O14827 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
RASGRF2O14827 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
RASGRF2O14827 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
RASGRF2O14827 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
RASGRF2O14827 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
RASGRF2O14827 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
RASGRF2O14827 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
RASGRF2O14827 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
RASGRF2O14827 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
RASGRF2O14827 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
RASGRF2O14827 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.41
RASGRF2O14827 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
RASGRF2O14827 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
RASGRF2O14827 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RASGRF2O14827 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RASGRF2O14827 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
RASGRF2O14827 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
RASGRF2O14827 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
RASGRF2O14827 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RASGRF2O14827 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
RASGRF2O14827 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
RASGRF2O14827 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
RASGRF2O14827 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RASGRF2O14827 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RASGRF2O14827 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RASGRF2O14827 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RASGRF2O14827 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RASGRF2O14827 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RASGRF2O14827 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RASGRF2O14827 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RASGRF2O14827 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RASGRF2O14827 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RASGRF2O14827 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RASGRF2O14827 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
RASGRF2O14827 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
RASGRF2O14827 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RASGRF2O14827 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RASGRF2O14827 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RASGRF2O14827 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RASGRF2O14827 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RASGRF2O14827 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RASGRF2O14827 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RASGRF2O14827 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RASGRF2O14827 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RASGRF2O14827 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RASGRF2O14827 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RASGRF2O14827 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RASGRF2O14827 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.3 ms