Protein–RNA interactions for Protein: O00110

OVOL3, Putative transcription factor ovo-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OVOL3O00110 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
OVOL3O00110 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
OVOL3O00110 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
OVOL3O00110 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
OVOL3O00110 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
OVOL3O00110 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
OVOL3O00110 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
OVOL3O00110 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
OVOL3O00110 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
OVOL3O00110 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
OVOL3O00110 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
OVOL3O00110 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
OVOL3O00110 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
OVOL3O00110 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
OVOL3O00110 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
OVOL3O00110 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
OVOL3O00110 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
OVOL3O00110 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
OVOL3O00110 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
OVOL3O00110 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
OVOL3O00110 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
OVOL3O00110 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
OVOL3O00110 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
OVOL3O00110 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
OVOL3O00110 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
OVOL3O00110 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
OVOL3O00110 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
OVOL3O00110 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
OVOL3O00110 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
OVOL3O00110 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
OVOL3O00110 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
OVOL3O00110 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
OVOL3O00110 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
OVOL3O00110 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
OVOL3O00110 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
OVOL3O00110 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
OVOL3O00110 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
OVOL3O00110 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
OVOL3O00110 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
OVOL3O00110 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
OVOL3O00110 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
OVOL3O00110 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
OVOL3O00110 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
OVOL3O00110 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
OVOL3O00110 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
OVOL3O00110 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
OVOL3O00110 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
OVOL3O00110 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
OVOL3O00110 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
OVOL3O00110 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
OVOL3O00110 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
OVOL3O00110 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
OVOL3O00110 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
OVOL3O00110 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
OVOL3O00110 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
OVOL3O00110 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
OVOL3O00110 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
OVOL3O00110 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
OVOL3O00110 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
OVOL3O00110 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
OVOL3O00110 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
OVOL3O00110 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
OVOL3O00110 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
OVOL3O00110 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
OVOL3O00110 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
OVOL3O00110 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
OVOL3O00110 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
OVOL3O00110 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
OVOL3O00110 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
OVOL3O00110 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
OVOL3O00110 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
OVOL3O00110 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
OVOL3O00110 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
OVOL3O00110 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
OVOL3O00110 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
OVOL3O00110 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
OVOL3O00110 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
OVOL3O00110 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
OVOL3O00110 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
OVOL3O00110 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
OVOL3O00110 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
OVOL3O00110 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
OVOL3O00110 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
OVOL3O00110 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
OVOL3O00110 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
OVOL3O00110 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
OVOL3O00110 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
OVOL3O00110 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
OVOL3O00110 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
OVOL3O00110 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
OVOL3O00110 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
OVOL3O00110 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
OVOL3O00110 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
OVOL3O00110 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
OVOL3O00110 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
OVOL3O00110 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
OVOL3O00110 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
OVOL3O00110 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
OVOL3O00110 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
OVOL3O00110 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms