Protein–RNA interactions for Protein: H3BMM5

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BMM5 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC33.55■■■□□ 2.96
H3BMM5 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
H3BMM5 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC32.82■■■□□ 2.85
H3BMM5 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
H3BMM5 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
H3BMM5 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
H3BMM5 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
H3BMM5 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
H3BMM5 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
H3BMM5 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
H3BMM5 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
H3BMM5 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
H3BMM5 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.74■■■□□ 2.67
H3BMM5 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
H3BMM5 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
H3BMM5 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.59
H3BMM5 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
H3BMM5 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
H3BMM5 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
H3BMM5 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
H3BMM5 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
H3BMM5 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
H3BMM5 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
H3BMM5 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
H3BMM5 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
H3BMM5 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
H3BMM5 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
H3BMM5 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
H3BMM5 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
H3BMM5 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
H3BMM5 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
H3BMM5 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
H3BMM5 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.43■■■□□ 2.46
H3BMM5 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
H3BMM5 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
H3BMM5 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
H3BMM5 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
H3BMM5 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
H3BMM5 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
H3BMM5 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.41
H3BMM5 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
H3BMM5 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
H3BMM5 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
H3BMM5 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
H3BMM5 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
H3BMM5 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
H3BMM5 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
H3BMM5 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
H3BMM5 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
H3BMM5 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
H3BMM5 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
H3BMM5 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
H3BMM5 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
H3BMM5 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
H3BMM5 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
H3BMM5 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
H3BMM5 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
H3BMM5 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
H3BMM5 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
H3BMM5 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
H3BMM5 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
H3BMM5 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
H3BMM5 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
H3BMM5 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
H3BMM5 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
H3BMM5 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
H3BMM5 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
H3BMM5 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
H3BMM5 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
H3BMM5 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
H3BMM5 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
H3BMM5 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
H3BMM5 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
H3BMM5 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
H3BMM5 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
H3BMM5 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
H3BMM5 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
H3BMM5 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
H3BMM5 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
H3BMM5 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
H3BMM5 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
H3BMM5 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
H3BMM5 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
H3BMM5 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
H3BMM5 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
H3BMM5 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
H3BMM5 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
H3BMM5 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
H3BMM5 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
H3BMM5 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
H3BMM5 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
H3BMM5 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
H3BMM5 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
H3BMM5 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
H3BMM5 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
H3BMM5 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
H3BMM5 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
H3BMM5 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
H3BMM5 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
H3BMM5 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.6 ms