Protein–RNA interactions for Protein: A0PJX4

SHISA3, Protein shisa-3 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA3A0PJX4 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SHISA3A0PJX4 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SHISA3A0PJX4 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SHISA3A0PJX4 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SHISA3A0PJX4 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SHISA3A0PJX4 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SHISA3A0PJX4 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SHISA3A0PJX4 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SHISA3A0PJX4 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SHISA3A0PJX4 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
SHISA3A0PJX4 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SHISA3A0PJX4 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SHISA3A0PJX4 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SHISA3A0PJX4 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SHISA3A0PJX4 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SHISA3A0PJX4 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SHISA3A0PJX4 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SHISA3A0PJX4 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SHISA3A0PJX4 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SHISA3A0PJX4 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SHISA3A0PJX4 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SHISA3A0PJX4 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SHISA3A0PJX4 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SHISA3A0PJX4 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SHISA3A0PJX4 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SHISA3A0PJX4 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SHISA3A0PJX4 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SHISA3A0PJX4 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SHISA3A0PJX4 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
SHISA3A0PJX4 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SHISA3A0PJX4 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SHISA3A0PJX4 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SHISA3A0PJX4 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SHISA3A0PJX4 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SHISA3A0PJX4 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SHISA3A0PJX4 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SHISA3A0PJX4 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SHISA3A0PJX4 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SHISA3A0PJX4 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SHISA3A0PJX4 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SHISA3A0PJX4 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SHISA3A0PJX4 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SHISA3A0PJX4 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SHISA3A0PJX4 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SHISA3A0PJX4 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SHISA3A0PJX4 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SHISA3A0PJX4 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SHISA3A0PJX4 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SHISA3A0PJX4 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SHISA3A0PJX4 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SHISA3A0PJX4 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SHISA3A0PJX4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SHISA3A0PJX4 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SHISA3A0PJX4 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SHISA3A0PJX4 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SHISA3A0PJX4 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SHISA3A0PJX4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SHISA3A0PJX4 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SHISA3A0PJX4 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SHISA3A0PJX4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SHISA3A0PJX4 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SHISA3A0PJX4 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SHISA3A0PJX4 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SHISA3A0PJX4 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SHISA3A0PJX4 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SHISA3A0PJX4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SHISA3A0PJX4 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SHISA3A0PJX4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SHISA3A0PJX4 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SHISA3A0PJX4 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SHISA3A0PJX4 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHISA3A0PJX4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHISA3A0PJX4 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SHISA3A0PJX4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SHISA3A0PJX4 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SHISA3A0PJX4 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SHISA3A0PJX4 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SHISA3A0PJX4 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SHISA3A0PJX4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SHISA3A0PJX4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SHISA3A0PJX4 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SHISA3A0PJX4 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SHISA3A0PJX4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SHISA3A0PJX4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SHISA3A0PJX4 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SHISA3A0PJX4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SHISA3A0PJX4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SHISA3A0PJX4 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SHISA3A0PJX4 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SHISA3A0PJX4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SHISA3A0PJX4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SHISA3A0PJX4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SHISA3A0PJX4 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SHISA3A0PJX4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SHISA3A0PJX4 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SHISA3A0PJX4 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SHISA3A0PJX4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SHISA3A0PJX4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SHISA3A0PJX4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SHISA3A0PJX4 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.6 ms