Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PRG0

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PRG0 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC40.52■■■■■ 4.08
A0A1W2PRG0 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC39.55■■■■□ 3.92
A0A1W2PRG0 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
A0A1W2PRG0 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
A0A1W2PRG0 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
A0A1W2PRG0 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.12■■■■□ 3.85
A0A1W2PRG0 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC38.95■■■■□ 3.83
A0A1W2PRG0 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.92■■■■□ 3.82
A0A1W2PRG0 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
A0A1W2PRG0 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
A0A1W2PRG0 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
A0A1W2PRG0 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
A0A1W2PRG0 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
A0A1W2PRG0 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC37.73■■■■□ 3.63
A0A1W2PRG0 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC37.69■■■■□ 3.62
A0A1W2PRG0 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
A0A1W2PRG0 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
A0A1W2PRG0 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
A0A1W2PRG0 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
A0A1W2PRG0 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
A0A1W2PRG0 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
A0A1W2PRG0 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
A0A1W2PRG0 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
A0A1W2PRG0 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
A0A1W2PRG0 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
A0A1W2PRG0 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
A0A1W2PRG0 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
A0A1W2PRG0 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
A0A1W2PRG0 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC36.61■■■■□ 3.45
A0A1W2PRG0 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
A0A1W2PRG0 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
A0A1W2PRG0 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
A0A1W2PRG0 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
A0A1W2PRG0 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
A0A1W2PRG0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
A0A1W2PRG0 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
A0A1W2PRG0 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
A0A1W2PRG0 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
A0A1W2PRG0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
A0A1W2PRG0 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC35.89■■■■□ 3.34
A0A1W2PRG0 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
A0A1W2PRG0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
A0A1W2PRG0 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
A0A1W2PRG0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
A0A1W2PRG0 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
A0A1W2PRG0 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
A0A1W2PRG0 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
A0A1W2PRG0 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC35.41■■■■□ 3.26
A0A1W2PRG0 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
A0A1W2PRG0 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
A0A1W2PRG0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
A0A1W2PRG0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
A0A1W2PRG0 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
A0A1W2PRG0 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
A0A1W2PRG0 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
A0A1W2PRG0 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
A0A1W2PRG0 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
A0A1W2PRG0 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
A0A1W2PRG0 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
A0A1W2PRG0 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
A0A1W2PRG0 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
A0A1W2PRG0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC34.94■■■■□ 3.18
A0A1W2PRG0 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
A0A1W2PRG0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
A0A1W2PRG0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
A0A1W2PRG0 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
A0A1W2PRG0 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC34.82■■■■□ 3.17
A0A1W2PRG0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
A0A1W2PRG0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC34.78■■■■□ 3.16
A0A1W2PRG0 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
A0A1W2PRG0 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
A0A1W2PRG0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
A0A1W2PRG0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
A0A1W2PRG0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
A0A1W2PRG0 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
A0A1W2PRG0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
A0A1W2PRG0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
A0A1W2PRG0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
A0A1W2PRG0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
A0A1W2PRG0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
A0A1W2PRG0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
A0A1W2PRG0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
A0A1W2PRG0 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
A0A1W2PRG0 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC34.47■■■■□ 3.11
A0A1W2PRG0 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
A0A1W2PRG0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
A0A1W2PRG0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
A0A1W2PRG0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
A0A1W2PRG0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
A0A1W2PRG0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
A0A1W2PRG0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
A0A1W2PRG0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
A0A1W2PRG0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
A0A1W2PRG0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
A0A1W2PRG0 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
A0A1W2PRG0 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
A0A1W2PRG0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
A0A1W2PRG0 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
A0A1W2PRG0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
A0A1W2PRG0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms