Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YY99

TNFSF12-TNFSF13, Protein TNFSF12-TNFSF13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.96■■■□□ 2.55
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms