Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A0MS04

TRBV6-7, T-cell receptor beta variable 6-7 (non-functional) (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV6-7A0A0A0MS04 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRBV6-7A0A0A0MS04 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRBV6-7A0A0A0MS04 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRBV6-7A0A0A0MS04 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRBV6-7A0A0A0MS04 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRBV6-7A0A0A0MS04 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC27.33■■□□□ 1.96
TRBV6-7A0A0A0MS04 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRBV6-7A0A0A0MS04 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRBV6-7A0A0A0MS04 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TRBV6-7A0A0A0MS04 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRBV6-7A0A0A0MS04 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRBV6-7A0A0A0MS04 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRBV6-7A0A0A0MS04 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRBV6-7A0A0A0MS04 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRBV6-7A0A0A0MS04 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRBV6-7A0A0A0MS04 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRBV6-7A0A0A0MS04 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRBV6-7A0A0A0MS04 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRBV6-7A0A0A0MS04 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRBV6-7A0A0A0MS04 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRBV6-7A0A0A0MS04 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRBV6-7A0A0A0MS04 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRBV6-7A0A0A0MS04 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRBV6-7A0A0A0MS04 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRBV6-7A0A0A0MS04 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRBV6-7A0A0A0MS04 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRBV6-7A0A0A0MS04 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRBV6-7A0A0A0MS04 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRBV6-7A0A0A0MS04 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
TRBV6-7A0A0A0MS04 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRBV6-7A0A0A0MS04 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRBV6-7A0A0A0MS04 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRBV6-7A0A0A0MS04 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
TRBV6-7A0A0A0MS04 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRBV6-7A0A0A0MS04 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRBV6-7A0A0A0MS04 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRBV6-7A0A0A0MS04 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRBV6-7A0A0A0MS04 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRBV6-7A0A0A0MS04 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRBV6-7A0A0A0MS04 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRBV6-7A0A0A0MS04 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRBV6-7A0A0A0MS04 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRBV6-7A0A0A0MS04 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRBV6-7A0A0A0MS04 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRBV6-7A0A0A0MS04 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRBV6-7A0A0A0MS04 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRBV6-7A0A0A0MS04 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRBV6-7A0A0A0MS04 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRBV6-7A0A0A0MS04 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRBV6-7A0A0A0MS04 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRBV6-7A0A0A0MS04 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRBV6-7A0A0A0MS04 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRBV6-7A0A0A0MS04 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRBV6-7A0A0A0MS04 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRBV6-7A0A0A0MS04 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRBV6-7A0A0A0MS04 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRBV6-7A0A0A0MS04 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRBV6-7A0A0A0MS04 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRBV6-7A0A0A0MS04 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRBV6-7A0A0A0MS04 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TRBV6-7A0A0A0MS04 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRBV6-7A0A0A0MS04 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRBV6-7A0A0A0MS04 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRBV6-7A0A0A0MS04 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRBV6-7A0A0A0MS04 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRBV6-7A0A0A0MS04 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRBV6-7A0A0A0MS04 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRBV6-7A0A0A0MS04 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRBV6-7A0A0A0MS04 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRBV6-7A0A0A0MS04 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRBV6-7A0A0A0MS04 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRBV6-7A0A0A0MS04 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRBV6-7A0A0A0MS04 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRBV6-7A0A0A0MS04 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRBV6-7A0A0A0MS04 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRBV6-7A0A0A0MS04 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRBV6-7A0A0A0MS04 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRBV6-7A0A0A0MS04 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRBV6-7A0A0A0MS04 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRBV6-7A0A0A0MS04 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRBV6-7A0A0A0MS04 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRBV6-7A0A0A0MS04 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRBV6-7A0A0A0MS04 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRBV6-7A0A0A0MS04 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRBV6-7A0A0A0MS04 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRBV6-7A0A0A0MS04 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRBV6-7A0A0A0MS04 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRBV6-7A0A0A0MS04 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRBV6-7A0A0A0MS04 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRBV6-7A0A0A0MS04 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRBV6-7A0A0A0MS04 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRBV6-7A0A0A0MS04 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRBV6-7A0A0A0MS04 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRBV6-7A0A0A0MS04 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRBV6-7A0A0A0MS04 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRBV6-7A0A0A0MS04 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRBV6-7A0A0A0MS04 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRBV6-7A0A0A0MS04 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRBV6-7A0A0A0MS04 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRBV6-7A0A0A0MS04 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
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