Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ9

CMTM5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM5Q96DZ9 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CMTM5Q96DZ9 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms