Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NPRL3Q12980 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NPRL3Q12980 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms