Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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RAB40BQ12829 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB40BQ12829 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB40BQ12829 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB40BQ12829 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB40BQ12829 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB40BQ12829 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB40BQ12829 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAB40BQ12829 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
RAB40BQ12829 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RAB40BQ12829 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
RAB40BQ12829 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RAB40BQ12829 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RAB40BQ12829 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RAB40BQ12829 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
RAB40BQ12829 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB40BQ12829 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB40BQ12829 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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RAB40BQ12829 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RAB40BQ12829 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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RAB40BQ12829 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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RAB40BQ12829 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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RAB40BQ12829 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB40BQ12829 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB40BQ12829 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB40BQ12829 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB40BQ12829 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB40BQ12829 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB40BQ12829 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB40BQ12829 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB40BQ12829 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB40BQ12829 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RAB40BQ12829 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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