Protein–RNA interactions for Protein: P18545

PDE6G, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6GP18545 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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PDE6GP18545 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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