Protein–RNA interactions for Protein: P15085

CPA1, Carboxypeptidase A1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA1P15085 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPA1P15085 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPA1P15085 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPA1P15085 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPA1P15085 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPA1P15085 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPA1P15085 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPA1P15085 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPA1P15085 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPA1P15085 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPA1P15085 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPA1P15085 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPA1P15085 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPA1P15085 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPA1P15085 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPA1P15085 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPA1P15085 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPA1P15085 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPA1P15085 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPA1P15085 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPA1P15085 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPA1P15085 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPA1P15085 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPA1P15085 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPA1P15085 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPA1P15085 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPA1P15085 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPA1P15085 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CPA1P15085 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPA1P15085 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPA1P15085 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPA1P15085 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPA1P15085 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPA1P15085 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPA1P15085 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPA1P15085 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPA1P15085 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPA1P15085 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CPA1P15085 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
CPA1P15085 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPA1P15085 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CPA1P15085 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPA1P15085 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPA1P15085 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPA1P15085 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPA1P15085 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPA1P15085 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPA1P15085 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPA1P15085 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPA1P15085 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPA1P15085 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPA1P15085 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPA1P15085 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPA1P15085 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPA1P15085 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPA1P15085 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CPA1P15085 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPA1P15085 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CPA1P15085 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPA1P15085 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPA1P15085 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPA1P15085 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CPA1P15085 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPA1P15085 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPA1P15085 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPA1P15085 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPA1P15085 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPA1P15085 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPA1P15085 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPA1P15085 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPA1P15085 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPA1P15085 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPA1P15085 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPA1P15085 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPA1P15085 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CPA1P15085 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPA1P15085 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPA1P15085 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPA1P15085 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPA1P15085 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPA1P15085 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPA1P15085 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPA1P15085 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CPA1P15085 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPA1P15085 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPA1P15085 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPA1P15085 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPA1P15085 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPA1P15085 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPA1P15085 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPA1P15085 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPA1P15085 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPA1P15085 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPA1P15085 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPA1P15085 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPA1P15085 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPA1P15085 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPA1P15085 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPA1P15085 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPA1P15085 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms