Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZS2

KLRF1, Killer cell lectin-like receptor subfamily F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLRF1Q9NZS2 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLRF1Q9NZS2 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLRF1Q9NZS2 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLRF1Q9NZS2 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLRF1Q9NZS2 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLRF1Q9NZS2 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLRF1Q9NZS2 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLRF1Q9NZS2 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLRF1Q9NZS2 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLRF1Q9NZS2 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLRF1Q9NZS2 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLRF1Q9NZS2 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLRF1Q9NZS2 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLRF1Q9NZS2 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLRF1Q9NZS2 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLRF1Q9NZS2 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLRF1Q9NZS2 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLRF1Q9NZS2 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLRF1Q9NZS2 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLRF1Q9NZS2 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLRF1Q9NZS2 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
KLRF1Q9NZS2 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLRF1Q9NZS2 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
KLRF1Q9NZS2 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
KLRF1Q9NZS2 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
KLRF1Q9NZS2 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
KLRF1Q9NZS2 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLRF1Q9NZS2 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLRF1Q9NZS2 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLRF1Q9NZS2 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLRF1Q9NZS2 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLRF1Q9NZS2 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLRF1Q9NZS2 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLRF1Q9NZS2 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
KLRF1Q9NZS2 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLRF1Q9NZS2 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLRF1Q9NZS2 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLRF1Q9NZS2 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLRF1Q9NZS2 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLRF1Q9NZS2 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLRF1Q9NZS2 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLRF1Q9NZS2 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLRF1Q9NZS2 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLRF1Q9NZS2 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLRF1Q9NZS2 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLRF1Q9NZS2 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLRF1Q9NZS2 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLRF1Q9NZS2 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLRF1Q9NZS2 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLRF1Q9NZS2 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLRF1Q9NZS2 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLRF1Q9NZS2 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLRF1Q9NZS2 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLRF1Q9NZS2 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLRF1Q9NZS2 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLRF1Q9NZS2 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLRF1Q9NZS2 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLRF1Q9NZS2 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
KLRF1Q9NZS2 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLRF1Q9NZS2 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLRF1Q9NZS2 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLRF1Q9NZS2 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLRF1Q9NZS2 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLRF1Q9NZS2 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLRF1Q9NZS2 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLRF1Q9NZS2 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLRF1Q9NZS2 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLRF1Q9NZS2 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLRF1Q9NZS2 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLRF1Q9NZS2 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLRF1Q9NZS2 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLRF1Q9NZS2 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLRF1Q9NZS2 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLRF1Q9NZS2 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLRF1Q9NZS2 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLRF1Q9NZS2 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLRF1Q9NZS2 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLRF1Q9NZS2 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLRF1Q9NZS2 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLRF1Q9NZS2 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLRF1Q9NZS2 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLRF1Q9NZS2 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLRF1Q9NZS2 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLRF1Q9NZS2 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLRF1Q9NZS2 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLRF1Q9NZS2 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
KLRF1Q9NZS2 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
KLRF1Q9NZS2 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLRF1Q9NZS2 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLRF1Q9NZS2 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLRF1Q9NZS2 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLRF1Q9NZS2 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLRF1Q9NZS2 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLRF1Q9NZS2 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLRF1Q9NZS2 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KLRF1Q9NZS2 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KLRF1Q9NZS2 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
KLRF1Q9NZS2 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KLRF1Q9NZS2 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KLRF1Q9NZS2 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms