Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GABARAPL3Q9BY60 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms