Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CSNK2A3Q8NEV1 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CSNK2A3Q8NEV1 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms