Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
MCCD1P59942 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCCD1P59942 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms