Protein–RNA interactions for Protein: P55087

AQP4, Aquaporin-4, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AQP4P55087 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
AQP4P55087 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
AQP4P55087 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
AQP4P55087 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
AQP4P55087 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
AQP4P55087 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
AQP4P55087 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
AQP4P55087 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
AQP4P55087 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
AQP4P55087 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
AQP4P55087 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
AQP4P55087 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
AQP4P55087 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AQP4P55087 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
AQP4P55087 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AQP4P55087 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AQP4P55087 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AQP4P55087 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
AQP4P55087 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
AQP4P55087 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AQP4P55087 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AQP4P55087 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AQP4P55087 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
AQP4P55087 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AQP4P55087 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
AQP4P55087 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AQP4P55087 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AQP4P55087 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
AQP4P55087 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
AQP4P55087 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
AQP4P55087 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
AQP4P55087 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AQP4P55087 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AQP4P55087 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
AQP4P55087 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AQP4P55087 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AQP4P55087 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AQP4P55087 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
AQP4P55087 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AQP4P55087 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
AQP4P55087 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AQP4P55087 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
AQP4P55087 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AQP4P55087 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AQP4P55087 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AQP4P55087 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
AQP4P55087 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
AQP4P55087 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AQP4P55087 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AQP4P55087 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AQP4P55087 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AQP4P55087 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
AQP4P55087 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
AQP4P55087 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
AQP4P55087 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
AQP4P55087 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AQP4P55087 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AQP4P55087 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AQP4P55087 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AQP4P55087 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AQP4P55087 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
AQP4P55087 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AQP4P55087 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
AQP4P55087 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AQP4P55087 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
AQP4P55087 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AQP4P55087 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
AQP4P55087 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
AQP4P55087 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
AQP4P55087 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AQP4P55087 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AQP4P55087 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AQP4P55087 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AQP4P55087 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AQP4P55087 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AQP4P55087 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AQP4P55087 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AQP4P55087 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AQP4P55087 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AQP4P55087 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AQP4P55087 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AQP4P55087 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AQP4P55087 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AQP4P55087 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AQP4P55087 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AQP4P55087 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AQP4P55087 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AQP4P55087 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AQP4P55087 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AQP4P55087 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AQP4P55087 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AQP4P55087 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AQP4P55087 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AQP4P55087 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
AQP4P55087 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AQP4P55087 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AQP4P55087 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
AQP4P55087 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AQP4P55087 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AQP4P55087 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms