Protein–RNA interactions for Protein: P51957

NEK4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, humanhuman

Predictions only

Length 841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK4P51957 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEK4P51957 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEK4P51957 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEK4P51957 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEK4P51957 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEK4P51957 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEK4P51957 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEK4P51957 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEK4P51957 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEK4P51957 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEK4P51957 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEK4P51957 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEK4P51957 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEK4P51957 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEK4P51957 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEK4P51957 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEK4P51957 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NEK4P51957 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEK4P51957 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEK4P51957 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEK4P51957 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEK4P51957 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEK4P51957 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEK4P51957 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEK4P51957 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NEK4P51957 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEK4P51957 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEK4P51957 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEK4P51957 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEK4P51957 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEK4P51957 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEK4P51957 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEK4P51957 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEK4P51957 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEK4P51957 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NEK4P51957 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEK4P51957 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEK4P51957 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEK4P51957 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEK4P51957 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEK4P51957 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEK4P51957 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEK4P51957 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEK4P51957 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NEK4P51957 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEK4P51957 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NEK4P51957 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEK4P51957 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEK4P51957 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEK4P51957 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEK4P51957 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEK4P51957 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEK4P51957 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEK4P51957 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEK4P51957 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NEK4P51957 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEK4P51957 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEK4P51957 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEK4P51957 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NEK4P51957 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEK4P51957 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NEK4P51957 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NEK4P51957 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEK4P51957 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEK4P51957 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEK4P51957 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEK4P51957 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEK4P51957 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEK4P51957 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEK4P51957 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEK4P51957 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NEK4P51957 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEK4P51957 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEK4P51957 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEK4P51957 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEK4P51957 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEK4P51957 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEK4P51957 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEK4P51957 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEK4P51957 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NEK4P51957 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEK4P51957 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEK4P51957 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEK4P51957 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEK4P51957 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEK4P51957 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEK4P51957 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEK4P51957 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEK4P51957 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEK4P51957 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEK4P51957 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NEK4P51957 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEK4P51957 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEK4P51957 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEK4P51957 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NEK4P51957 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEK4P51957 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEK4P51957 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEK4P51957 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NEK4P51957 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms