Protein–RNA interactions for Protein: P26599

PTBP1, Polypyrimidine tract-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTBP1P26599 EPB41L2-216ENST00000527411 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.863e-7■■■■■ 28.4
PTBP1P26599 EPB41L2-224ENST00000530481 3914 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.863e-7■■■■■ 28.4
PTBP1P26599 PIGT-210ENST00000638241 2006 ntTSL 29.65□□□□□ -0.872e-7■■■■■ 28.4
PTBP1P26599 PIGT-225ENST00000638689 4314 ntTSL 59.32□□□□□ -0.922e-7■■■■■ 28.4
PTBP1P26599 PIGT-229ENST00000638745 6087 ntTSL 59.28□□□□□ -0.922e-7■■■■■ 28.4
PTBP1P26599 STYXL1-206ENST00000431581 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.955e-6■■■■■ 28.4
PTBP1P26599 STYXL1-207ENST00000438695 764 ntTSL 1 (best)8.98□□□□□ -0.975e-6■■■■■ 28.4
PTBP1P26599 STYXL1-205ENST00000430497 651 ntTSL 1 (best)8.98□□□□□ -0.975e-6■■■■■ 28.4
PTBP1P26599 EPB41L2-201ENST00000337057 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.023e-7■■■■■ 28.4
PTBP1P26599 PIGT-258ENST00000640253 1418 ntTSL 28.63□□□□□ -1.032e-7■■■■■ 28.4
PTBP1P26599 STYXL1-202ENST00000340062 953 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.045e-6■■■■■ 28.4
PTBP1P26599 PIGT-265ENST00000640638 1196 ntTSL 28.47□□□□□ -1.051e-7■■■■■ 28.4
PTBP1P26599 PIGT-241ENST00000639250 3363 ntTSL 58.12□□□□□ -1.112e-7■■■■■ 28.4
PTBP1P26599 PIGT-212ENST00000638277 879 ntTSL 56.58□□□□□ -1.362e-7■■■■■ 28.4
PTBP1P26599 EPB41L2-212ENST00000526333 549 ntTSL 56.05□□□□□ -1.447e-7■■■■■ 28.4
PTBP1P26599 EPB41L2-219ENST00000528179 560 ntTSL 54.1□□□□□ -1.757e-7■■■■■ 28.4
PTBP1P26599 STYXL1-209ENST00000454618 663 ntTSL 1 (best)3.97□□□□□ -1.775e-6■■■■■ 28.4
PTBP1P26599 AP000781.2-201ENST00000534081 1639 ntTSL 211.75□□□□□ -0.534e-7■■■■■ 28.4
PTBP1P26599 VTA1-204ENST00000491881 528 ntTSL 22.91□□□□□ -1.943e-8■■■■■ 28.4
PTBP1P26599 CDON-204ENST00000527967 722 ntTSL 317.95■□□□□ 0.465e-7■■■■■ 28.4
PTBP1P26599 CDON-202ENST00000392693 9138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.315e-7■■■■■ 28.4
PTBP1P26599 CDON-201ENST00000263577 4186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.435e-7■■■■■ 28.4
PTBP1P26599 CDON-205ENST00000531586 624 ntTSL 55.45□□□□□ -1.545e-7■■■■■ 28.4
PTBP1P26599 CDON-209ENST00000534818 459 ntTSL 34.45□□□□□ -1.75e-7■■■■■ 28.4
PTBP1P26599 CRYBB2P1-206ENST00000609513 2819 nt7.55□□□□□ -1.21e-18■■■■■ 28.4
PTBP1P26599 L3MBTL4-208ENST00000583809 549 ntTSL 418.22■□□□□ 0.514e-7■■■■■ 28.4
PTBP1P26599 L3MBTL4-206ENST00000581231 568 ntTSL 58.35□□□□□ -1.074e-7■■■■■ 28.4
PTBP1P26599 FER-203ENST00000502752 1584 ntTSL 1 (best)5.46□□□□□ -1.544e-9■■■■■ 28.4
PTBP1P26599 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.127e-8■■■■■ 28.4
PTBP1P26599 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.144e-7■■■■■ 28.4
PTBP1P26599 ZNF618-206ENST00000481558 1126 ntTSL 513.01□□□□□ -0.336e-7■■■■■ 28.4
PTBP1P26599 ZNF618-202ENST00000374124 1156 ntTSL 510.84□□□□□ -0.676e-7■■■■■ 28.4
PTBP1P26599 ZNF618-204ENST00000452710 942 ntTSL 59.2□□□□□ -0.946e-7■■■■■ 28.4
PTBP1P26599 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.044e-7■■■■■ 28.4
PTBP1P26599 ZNF280D-203ENST00000558067 3528 ntTSL 21.99□□□□□ -2.094e-7■■■■■ 28.4
PTBP1P26599 AC097103.2-205ENST00000515247 567 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.282e-6■■■■■ 28.4
PTBP1P26599 FNDC3B-207ENST00000469491 2916 ntTSL 215.08■□□□□ 02e-7■■■■■ 28.4
PTBP1P26599 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.178e-7■■■■■ 28.4
PTBP1P26599 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.178e-7■■■■■ 28.4
PTBP1P26599 SLC38A5-205ENST00000441948 871 ntTSL 511.98□□□□□ -0.498e-7■■■■■ 28.4
PTBP1P26599 SLC38A5-209ENST00000497336 493 ntTSL 511.98□□□□□ -0.498e-7■■■■■ 28.4
PTBP1P26599 SLC38A5-202ENST00000416711 708 ntTSL 511.09□□□□□ -0.638e-7■■■■■ 28.4
PTBP1P26599 SLC38A5-204ENST00000440085 910 ntTSL 310.83□□□□□ -0.688e-7■■■■■ 28.4
PTBP1P26599 FNDC3B-202ENST00000415807 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.761e-7■■■■■ 28.4
PTBP1P26599 SLC38A5-201ENST00000413668 741 ntTSL 29.44□□□□□ -0.98e-7■■■■■ 28.4
PTBP1P26599 FNDC3B-201ENST00000336824 7904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.081e-7■■■■■ 28.4
PTBP1P26599 SLC38A5-208ENST00000494034 525 ntTSL 58.27□□□□□ -1.098e-7■■■■■ 28.4
PTBP1P26599 PHKB-208ENST00000566044 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.517e-7■■■■■ 28.4
PTBP1P26599 PHKB-202ENST00000323584 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.797e-7■■■■■ 28.4
PTBP1P26599 PHKB-201ENST00000299167 5464 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.257e-7■■■■■ 28.4
PTBP1P26599 RAB2A-202ENST00000396696 614 ntTSL 29.74□□□□□ -0.851e-6■■■■■ 28.4
PTBP1P26599 RERE-203ENST00000400907 2973 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.232e-7■■■■■ 28.4
PTBP1P26599 RC3H1-203ENST00000367696 11261 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.162e-7■■■■■ 28.4
PTBP1P26599 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.661e-6■■■■■ 28.4
PTBP1P26599 RPE-208ENST00000436630 1128 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.61e-7■■■■■ 28.4
PTBP1P26599 RPE-202ENST00000359429 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.771e-7■■■■■ 28.4
PTBP1P26599 RPE-201ENST00000354506 3165 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.971e-7■■■■■ 28.4
PTBP1P26599 RPE-206ENST00000429921 2511 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.981e-7■■■■■ 28.4
PTBP1P26599 RPE-216ENST00000454822 2130 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.141e-7■■■■■ 28.4
PTBP1P26599 RPE-214ENST00000452025 779 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.151e-7■■■■■ 28.4
PTBP1P26599 RPE-207ENST00000435437 858 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.341e-7■■■■■ 28.4
PTBP1P26599 RPE-211ENST00000438265 668 ntTSL 36.55□□□□□ -1.361e-7■■■■■ 28.4
PTBP1P26599 RPE-204ENST00000411934 792 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.361e-7■■■■■ 28.4
PTBP1P26599 RPE-213ENST00000445268 668 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.391e-7■■■■■ 28.4
PTBP1P26599 RPE-210ENST00000438204 796 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.391e-7■■■■■ 28.4
PTBP1P26599 RPE-212ENST00000441588 496 ntTSL 46.35□□□□□ -1.391e-7■■■■■ 28.4
PTBP1P26599 RPE-209ENST00000438191 426 ntTSL 56.06□□□□□ -1.441e-7■■■■■ 28.4
PTBP1P26599 RPE-205ENST00000429907 925 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.461e-7■■■■■ 28.4
PTBP1P26599 RPE-203ENST00000408981 737 ntTSL 55.35□□□□□ -1.551e-7■■■■■ 28.4
PTBP1P26599 RPE-215ENST00000453724 546 ntTSL 55.01□□□□□ -1.611e-7■■■■■ 28.4
PTBP1P26599 MNAT1-201ENST00000261245 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.614e-7■■■■■ 28.3
PTBP1P26599 MNAT1-202ENST00000539616 1220 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.044e-7■■■■■ 28.3
PTBP1P26599 HIVEP2-203ENST00000367604 10032 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.837e-7■■■■■ 28.3
PTBP1P26599 HIVEP2-201ENST00000012134 9755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.17e-7■■■■■ 28.3
PTBP1P26599 HIVEP2-202ENST00000367603 9724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.137e-7■■■■■ 28.3
PTBP1P26599 ELL2-207ENST00000515020 340 ntTSL 218.71■□□□□ 0.592e-7■■■■■ 28.3
PTBP1P26599 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.31e-6■■■■■ 28.3
PTBP1P26599 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.381e-6■■■■■ 28.3
PTBP1P26599 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.411e-6■■■■■ 28.3
PTBP1P26599 KLHL13-208ENST00000541812 3102 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.741e-6■■■■■ 28.3
PTBP1P26599 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.166e-8■■■■■ 28.3
PTBP1P26599 ASPM-203ENST00000367409 10887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.116e-8■■■■■ 28.3
PTBP1P26599 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.176e-8■■■■■ 28.3
PTBP1P26599 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.531e-6■■■■■ 28.3
PTBP1P26599 SDCCAG8-201ENST00000366541 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.582e-9■■■■■ 28.3
PTBP1P26599 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.442e-7■■■■■ 28.3
PTBP1P26599 SNX4-203ENST00000471751 1308 ntTSL 216■□□□□ 0.152e-7■■■■■ 28.3
PTBP1P26599 SNX4-204ENST00000473417 754 ntTSL 314.05□□□□□ -0.162e-7■■■■■ 28.3
PTBP1P26599 AC008014.1-201ENST00000551503 829 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.255e-8■■■■■ 28.3
PTBP1P26599 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.328e-7■■■■■ 28.3
PTBP1P26599 DYRK1A-204ENST00000398960 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.918e-7■■■■■ 28.3
PTBP1P26599 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.668e-7■■■■■ 28.3
PTBP1P26599 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.412e-11■■■■■ 28.3
PTBP1P26599 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.112e-11■■■■■ 28.3
PTBP1P26599 NSDHL-202ENST00000432467 994 ntAPPRIS ALT2 TSL 311.6□□□□□ -0.552e-11■■■■■ 28.3
PTBP1P26599 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.352e-10■■■■■ 28.3
PTBP1P26599 NCSTN-202ENST00000368063 3031 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.392e-10■■■■■ 28.3
PTBP1P26599 NCSTN-214ENST00000491390 592 ntTSL 38.68□□□□□ -1.022e-10■■■■■ 28.3
PTBP1P26599 NCSTN-206ENST00000435149 824 ntTSL 36.03□□□□□ -1.442e-10■■■■■ 28.3
PTBP1P26599 ITGB5-208ENST00000483168 576 ntTSL 411.81□□□□□ -0.522e-6■■■■■ 28.2
Retrieved 100 of 27,725 protein–RNA pairs in 177.1 ms