Protein–RNA interactions for Protein: P01780

IGHV3-7, Immunoglobulin heavy variable 3-7, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-7P01780 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHV3-7P01780 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms