Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD5

SLC6A13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A13Q9NSD5 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC6A13Q9NSD5 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC6A13Q9NSD5 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms