Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU20

RSG1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSG1Q9BU20 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms