Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms