Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC27Q2M243 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC27Q2M243 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC27Q2M243 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC27Q2M243 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC27Q2M243 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC27Q2M243 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC27Q2M243 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC27Q2M243 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC27Q2M243 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC27Q2M243 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC27Q2M243 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC27Q2M243 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC27Q2M243 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC27Q2M243 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC27Q2M243 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC27Q2M243 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC27Q2M243 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC27Q2M243 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC27Q2M243 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC27Q2M243 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC27Q2M243 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC27Q2M243 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC27Q2M243 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC27Q2M243 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC27Q2M243 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC27Q2M243 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC27Q2M243 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC27Q2M243 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC27Q2M243 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC27Q2M243 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC27Q2M243 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC27Q2M243 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC27Q2M243 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC27Q2M243 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC27Q2M243 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC27Q2M243 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC27Q2M243 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC27Q2M243 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC27Q2M243 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC27Q2M243 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC27Q2M243 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC27Q2M243 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC27Q2M243 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC27Q2M243 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC27Q2M243 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC27Q2M243 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC27Q2M243 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC27Q2M243 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC27Q2M243 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC27Q2M243 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC27Q2M243 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC27Q2M243 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC27Q2M243 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC27Q2M243 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC27Q2M243 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC27Q2M243 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC27Q2M243 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC27Q2M243 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC27Q2M243 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC27Q2M243 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC27Q2M243 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC27Q2M243 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC27Q2M243 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC27Q2M243 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC27Q2M243 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC27Q2M243 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC27Q2M243 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC27Q2M243 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC27Q2M243 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC27Q2M243 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC27Q2M243 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC27Q2M243 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC27Q2M243 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC27Q2M243 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC27Q2M243 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC27Q2M243 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC27Q2M243 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC27Q2M243 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC27Q2M243 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC27Q2M243 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC27Q2M243 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC27Q2M243 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC27Q2M243 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC27Q2M243 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC27Q2M243 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC27Q2M243 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC27Q2M243 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC27Q2M243 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC27Q2M243 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC27Q2M243 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC27Q2M243 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC27Q2M243 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC27Q2M243 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC27Q2M243 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC27Q2M243 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC27Q2M243 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC27Q2M243 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC27Q2M243 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC27Q2M243 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms