Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTMAP06454 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTMAP06454 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTMAP06454 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTMAP06454 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTMAP06454 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTMAP06454 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTMAP06454 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTMAP06454 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTMAP06454 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTMAP06454 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTMAP06454 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTMAP06454 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTMAP06454 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTMAP06454 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTMAP06454 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTMAP06454 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTMAP06454 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTMAP06454 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTMAP06454 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTMAP06454 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTMAP06454 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTMAP06454 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTMAP06454 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTMAP06454 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTMAP06454 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTMAP06454 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTMAP06454 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTMAP06454 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTMAP06454 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTMAP06454 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PTMAP06454 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTMAP06454 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTMAP06454 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PTMAP06454 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTMAP06454 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTMAP06454 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTMAP06454 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTMAP06454 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTMAP06454 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTMAP06454 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PTMAP06454 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTMAP06454 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTMAP06454 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTMAP06454 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTMAP06454 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTMAP06454 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PTMAP06454 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PTMAP06454 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTMAP06454 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTMAP06454 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTMAP06454 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTMAP06454 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTMAP06454 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTMAP06454 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTMAP06454 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTMAP06454 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PTMAP06454 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTMAP06454 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTMAP06454 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTMAP06454 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTMAP06454 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTMAP06454 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTMAP06454 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PTMAP06454 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTMAP06454 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PTMAP06454 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTMAP06454 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTMAP06454 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTMAP06454 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PTMAP06454 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTMAP06454 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
PTMAP06454 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PTMAP06454 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PTMAP06454 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTMAP06454 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTMAP06454 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTMAP06454 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTMAP06454 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PTMAP06454 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTMAP06454 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTMAP06454 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTMAP06454 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PTMAP06454 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PTMAP06454 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTMAP06454 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PTMAP06454 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PTMAP06454 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PTMAP06454 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTMAP06454 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTMAP06454 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTMAP06454 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTMAP06454 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTMAP06454 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTMAP06454 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTMAP06454 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTMAP06454 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTMAP06454 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTMAP06454 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTMAP06454 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms