Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U9

KLHDC2, Kelch domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC2Q9Y2U9 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHDC2Q9Y2U9 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHDC2Q9Y2U9 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHDC2Q9Y2U9 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHDC2Q9Y2U9 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHDC2Q9Y2U9 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHDC2Q9Y2U9 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHDC2Q9Y2U9 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHDC2Q9Y2U9 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHDC2Q9Y2U9 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHDC2Q9Y2U9 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHDC2Q9Y2U9 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHDC2Q9Y2U9 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHDC2Q9Y2U9 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHDC2Q9Y2U9 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHDC2Q9Y2U9 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHDC2Q9Y2U9 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHDC2Q9Y2U9 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHDC2Q9Y2U9 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHDC2Q9Y2U9 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHDC2Q9Y2U9 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHDC2Q9Y2U9 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHDC2Q9Y2U9 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHDC2Q9Y2U9 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHDC2Q9Y2U9 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHDC2Q9Y2U9 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHDC2Q9Y2U9 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHDC2Q9Y2U9 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHDC2Q9Y2U9 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHDC2Q9Y2U9 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHDC2Q9Y2U9 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHDC2Q9Y2U9 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHDC2Q9Y2U9 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHDC2Q9Y2U9 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHDC2Q9Y2U9 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHDC2Q9Y2U9 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHDC2Q9Y2U9 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHDC2Q9Y2U9 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHDC2Q9Y2U9 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHDC2Q9Y2U9 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHDC2Q9Y2U9 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHDC2Q9Y2U9 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHDC2Q9Y2U9 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHDC2Q9Y2U9 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHDC2Q9Y2U9 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHDC2Q9Y2U9 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHDC2Q9Y2U9 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHDC2Q9Y2U9 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHDC2Q9Y2U9 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHDC2Q9Y2U9 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHDC2Q9Y2U9 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHDC2Q9Y2U9 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHDC2Q9Y2U9 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHDC2Q9Y2U9 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHDC2Q9Y2U9 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHDC2Q9Y2U9 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHDC2Q9Y2U9 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLHDC2Q9Y2U9 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHDC2Q9Y2U9 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHDC2Q9Y2U9 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHDC2Q9Y2U9 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHDC2Q9Y2U9 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHDC2Q9Y2U9 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHDC2Q9Y2U9 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHDC2Q9Y2U9 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHDC2Q9Y2U9 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHDC2Q9Y2U9 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHDC2Q9Y2U9 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHDC2Q9Y2U9 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHDC2Q9Y2U9 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHDC2Q9Y2U9 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHDC2Q9Y2U9 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHDC2Q9Y2U9 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHDC2Q9Y2U9 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHDC2Q9Y2U9 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHDC2Q9Y2U9 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHDC2Q9Y2U9 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHDC2Q9Y2U9 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHDC2Q9Y2U9 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHDC2Q9Y2U9 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHDC2Q9Y2U9 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHDC2Q9Y2U9 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHDC2Q9Y2U9 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHDC2Q9Y2U9 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHDC2Q9Y2U9 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHDC2Q9Y2U9 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHDC2Q9Y2U9 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHDC2Q9Y2U9 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHDC2Q9Y2U9 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHDC2Q9Y2U9 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHDC2Q9Y2U9 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHDC2Q9Y2U9 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHDC2Q9Y2U9 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHDC2Q9Y2U9 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHDC2Q9Y2U9 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHDC2Q9Y2U9 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHDC2Q9Y2U9 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHDC2Q9Y2U9 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHDC2Q9Y2U9 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHDC2Q9Y2U9 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms