Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC2LQ9UL33 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC2LQ9UL33 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC2LQ9UL33 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRAPPC2LQ9UL33 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC2LQ9UL33 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC2LQ9UL33 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC2LQ9UL33 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC2LQ9UL33 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC2LQ9UL33 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC2LQ9UL33 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC2LQ9UL33 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC2LQ9UL33 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC2LQ9UL33 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC2LQ9UL33 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC2LQ9UL33 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC2LQ9UL33 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC2LQ9UL33 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC2LQ9UL33 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC2LQ9UL33 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC2LQ9UL33 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC2LQ9UL33 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC2LQ9UL33 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC2LQ9UL33 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC2LQ9UL33 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC2LQ9UL33 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC2LQ9UL33 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC2LQ9UL33 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC2LQ9UL33 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TRAPPC2LQ9UL33 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms