Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUCB1Q02818 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUCB1Q02818 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms