Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXC5Q00444 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXC5Q00444 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms