Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCKARP32238 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCKARP32238 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCKARP32238 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCKARP32238 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCKARP32238 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCKARP32238 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCKARP32238 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCKARP32238 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCKARP32238 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCKARP32238 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCKARP32238 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCKARP32238 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCKARP32238 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCKARP32238 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCKARP32238 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCKARP32238 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCKARP32238 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCKARP32238 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCKARP32238 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCKARP32238 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCKARP32238 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCKARP32238 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCKARP32238 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCKARP32238 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCKARP32238 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCKARP32238 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCKARP32238 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCKARP32238 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCKARP32238 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCKARP32238 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCKARP32238 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCKARP32238 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCKARP32238 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCKARP32238 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCKARP32238 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCKARP32238 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCKARP32238 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCKARP32238 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCKARP32238 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCKARP32238 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCKARP32238 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCKARP32238 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCKARP32238 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCKARP32238 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCKARP32238 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCKARP32238 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCKARP32238 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCKARP32238 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCKARP32238 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCKARP32238 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCKARP32238 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCKARP32238 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCKARP32238 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCKARP32238 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCKARP32238 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCKARP32238 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCKARP32238 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCKARP32238 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCKARP32238 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCKARP32238 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCKARP32238 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCKARP32238 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCKARP32238 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCKARP32238 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCKARP32238 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CCKARP32238 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCKARP32238 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCKARP32238 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCKARP32238 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCKARP32238 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCKARP32238 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCKARP32238 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCKARP32238 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCKARP32238 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCKARP32238 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCKARP32238 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCKARP32238 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCKARP32238 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCKARP32238 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCKARP32238 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCKARP32238 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCKARP32238 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCKARP32238 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCKARP32238 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCKARP32238 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCKARP32238 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCKARP32238 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCKARP32238 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCKARP32238 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCKARP32238 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCKARP32238 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCKARP32238 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCKARP32238 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCKARP32238 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCKARP32238 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CCKARP32238 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCKARP32238 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCKARP32238 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CCKARP32238 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.7 ms