Protein–RNA interactions for Protein: P20941

PDC, Phosducin, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCP20941 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCP20941 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCP20941 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCP20941 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCP20941 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCP20941 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCP20941 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCP20941 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCP20941 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCP20941 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCP20941 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCP20941 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCP20941 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCP20941 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCP20941 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCP20941 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCP20941 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCP20941 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCP20941 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCP20941 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCP20941 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCP20941 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCP20941 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCP20941 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCP20941 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCP20941 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCP20941 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCP20941 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCP20941 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCP20941 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCP20941 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCP20941 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCP20941 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCP20941 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCP20941 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCP20941 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCP20941 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCP20941 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCP20941 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCP20941 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCP20941 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCP20941 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCP20941 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCP20941 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCP20941 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCP20941 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCP20941 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCP20941 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCP20941 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDCP20941 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDCP20941 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDCP20941 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDCP20941 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDCP20941 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDCP20941 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDCP20941 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDCP20941 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDCP20941 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDCP20941 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDCP20941 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDCP20941 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDCP20941 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDCP20941 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDCP20941 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDCP20941 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDCP20941 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDCP20941 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDCP20941 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDCP20941 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDCP20941 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDCP20941 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDCP20941 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDCP20941 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDCP20941 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDCP20941 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDCP20941 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDCP20941 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDCP20941 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDCP20941 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDCP20941 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDCP20941 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDCP20941 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDCP20941 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDCP20941 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDCP20941 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDCP20941 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDCP20941 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDCP20941 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDCP20941 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDCP20941 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PDCP20941 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDCP20941 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDCP20941 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDCP20941 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDCP20941 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PDCP20941 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDCP20941 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDCP20941 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDCP20941 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDCP20941 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms