Protein–RNA interactions for Protein: P13682

ZNF35, Zinc finger protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF35P13682 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZNF35P13682 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZNF35P13682 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZNF35P13682 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZNF35P13682 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZNF35P13682 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZNF35P13682 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZNF35P13682 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZNF35P13682 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZNF35P13682 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZNF35P13682 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZNF35P13682 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
ZNF35P13682 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ZNF35P13682 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
ZNF35P13682 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ZNF35P13682 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ZNF35P13682 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNF35P13682 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNF35P13682 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNF35P13682 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNF35P13682 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNF35P13682 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNF35P13682 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNF35P13682 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNF35P13682 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNF35P13682 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNF35P13682 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNF35P13682 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNF35P13682 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZNF35P13682 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF35P13682 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF35P13682 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF35P13682 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF35P13682 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF35P13682 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF35P13682 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF35P13682 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF35P13682 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF35P13682 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF35P13682 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF35P13682 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF35P13682 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF35P13682 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF35P13682 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF35P13682 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF35P13682 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF35P13682 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF35P13682 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF35P13682 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF35P13682 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF35P13682 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF35P13682 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF35P13682 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF35P13682 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF35P13682 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF35P13682 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF35P13682 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF35P13682 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF35P13682 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF35P13682 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF35P13682 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF35P13682 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF35P13682 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF35P13682 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF35P13682 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF35P13682 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZNF35P13682 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF35P13682 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF35P13682 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF35P13682 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF35P13682 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF35P13682 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF35P13682 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF35P13682 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF35P13682 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF35P13682 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF35P13682 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF35P13682 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF35P13682 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF35P13682 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF35P13682 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF35P13682 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF35P13682 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF35P13682 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF35P13682 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF35P13682 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF35P13682 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF35P13682 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF35P13682 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF35P13682 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF35P13682 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF35P13682 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF35P13682 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF35P13682 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF35P13682 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF35P13682 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF35P13682 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF35P13682 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF35P13682 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ZNF35P13682 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms