Protein–RNA interactions for Protein: A6NEH6

TMEM247, Transmembrane protein 247, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM247A6NEH6 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM247A6NEH6 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms