Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y251

HPSE, Heparanase, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPSEQ9Y251 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HPSEQ9Y251 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HPSEQ9Y251 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HPSEQ9Y251 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HPSEQ9Y251 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HPSEQ9Y251 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HPSEQ9Y251 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HPSEQ9Y251 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HPSEQ9Y251 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HPSEQ9Y251 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HPSEQ9Y251 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HPSEQ9Y251 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HPSEQ9Y251 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HPSEQ9Y251 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HPSEQ9Y251 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HPSEQ9Y251 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HPSEQ9Y251 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HPSEQ9Y251 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HPSEQ9Y251 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HPSEQ9Y251 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HPSEQ9Y251 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HPSEQ9Y251 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HPSEQ9Y251 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HPSEQ9Y251 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HPSEQ9Y251 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
HPSEQ9Y251 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HPSEQ9Y251 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HPSEQ9Y251 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms