Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SS18Q15532 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SS18Q15532 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SS18Q15532 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SS18Q15532 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SS18Q15532 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SS18Q15532 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SS18Q15532 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SS18Q15532 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SS18Q15532 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SS18Q15532 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SS18Q15532 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SS18Q15532 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SS18Q15532 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SS18Q15532 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SS18Q15532 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SS18Q15532 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SS18Q15532 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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SS18Q15532 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SS18Q15532 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SS18Q15532 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SS18Q15532 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SS18Q15532 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SS18Q15532 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SS18Q15532 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SS18Q15532 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SS18Q15532 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SS18Q15532 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SS18Q15532 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SS18Q15532 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SS18Q15532 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SS18Q15532 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SS18Q15532 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SS18Q15532 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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SS18Q15532 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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SS18Q15532 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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SS18Q15532 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SS18Q15532 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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SS18Q15532 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SS18Q15532 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SS18Q15532 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SS18Q15532 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SS18Q15532 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SS18Q15532 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SS18Q15532 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SS18Q15532 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SS18Q15532 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SS18Q15532 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SS18Q15532 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SS18Q15532 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SS18Q15532 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SS18Q15532 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SS18Q15532 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SS18Q15532 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SS18Q15532 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SS18Q15532 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SS18Q15532 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SS18Q15532 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SS18Q15532 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SS18Q15532 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SS18Q15532 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SS18Q15532 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SS18Q15532 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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