Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CDK5Q00535 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK5Q00535 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms