Protein–RNA interactions for Protein: P78539

SRPX, Sushi repeat-containing protein SRPX, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPXP78539 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRPXP78539 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRPXP78539 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRPXP78539 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRPXP78539 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRPXP78539 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRPXP78539 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRPXP78539 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRPXP78539 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRPXP78539 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRPXP78539 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRPXP78539 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRPXP78539 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRPXP78539 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRPXP78539 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRPXP78539 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRPXP78539 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRPXP78539 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRPXP78539 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRPXP78539 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRPXP78539 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRPXP78539 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SRPXP78539 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRPXP78539 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRPXP78539 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRPXP78539 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRPXP78539 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRPXP78539 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRPXP78539 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRPXP78539 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRPXP78539 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRPXP78539 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SRPXP78539 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRPXP78539 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRPXP78539 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRPXP78539 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRPXP78539 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRPXP78539 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRPXP78539 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRPXP78539 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRPXP78539 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRPXP78539 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRPXP78539 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRPXP78539 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRPXP78539 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRPXP78539 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRPXP78539 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRPXP78539 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRPXP78539 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRPXP78539 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRPXP78539 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRPXP78539 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRPXP78539 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRPXP78539 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRPXP78539 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRPXP78539 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRPXP78539 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRPXP78539 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRPXP78539 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRPXP78539 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRPXP78539 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRPXP78539 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRPXP78539 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRPXP78539 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SRPXP78539 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRPXP78539 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRPXP78539 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRPXP78539 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRPXP78539 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRPXP78539 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRPXP78539 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRPXP78539 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRPXP78539 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRPXP78539 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRPXP78539 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRPXP78539 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRPXP78539 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRPXP78539 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRPXP78539 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRPXP78539 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRPXP78539 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRPXP78539 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRPXP78539 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRPXP78539 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRPXP78539 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRPXP78539 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRPXP78539 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRPXP78539 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRPXP78539 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRPXP78539 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRPXP78539 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRPXP78539 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRPXP78539 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRPXP78539 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SRPXP78539 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRPXP78539 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRPXP78539 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRPXP78539 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRPXP78539 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SRPXP78539 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms