Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J203

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0B4J203 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
A0A0B4J203 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
A0A0B4J203 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
A0A0B4J203 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
A0A0B4J203 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
A0A0B4J203 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
A0A0B4J203 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
A0A0B4J203 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
A0A0B4J203 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
A0A0B4J203 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
A0A0B4J203 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
A0A0B4J203 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
A0A0B4J203 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
A0A0B4J203 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
A0A0B4J203 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
A0A0B4J203 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
A0A0B4J203 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A0A0B4J203 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A0A0B4J203 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A0A0B4J203 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
A0A0B4J203 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
A0A0B4J203 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A0A0B4J203 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A0A0B4J203 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A0A0B4J203 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
A0A0B4J203 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A0A0B4J203 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A0A0B4J203 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A0A0B4J203 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
A0A0B4J203 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A0A0B4J203 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
A0A0B4J203 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
A0A0B4J203 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A0A0B4J203 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
A0A0B4J203 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
A0A0B4J203 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
A0A0B4J203 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A0A0B4J203 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
A0A0B4J203 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A0A0B4J203 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A0A0B4J203 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A0A0B4J203 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A0A0B4J203 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
A0A0B4J203 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
A0A0B4J203 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A0A0B4J203 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A0A0B4J203 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A0A0B4J203 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A0A0B4J203 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A0A0B4J203 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A0A0B4J203 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A0A0B4J203 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
A0A0B4J203 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A0A0B4J203 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
A0A0B4J203 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
A0A0B4J203 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A0A0B4J203 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A0A0B4J203 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A0A0B4J203 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A0A0B4J203 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
A0A0B4J203 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
A0A0B4J203 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
A0A0B4J203 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A0A0B4J203 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
A0A0B4J203 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
A0A0B4J203 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
A0A0B4J203 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
A0A0B4J203 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A0A0B4J203 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
A0A0B4J203 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
A0A0B4J203 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
A0A0B4J203 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
A0A0B4J203 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
A0A0B4J203 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A0A0B4J203 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A0A0B4J203 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A0A0B4J203 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
A0A0B4J203 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A0A0B4J203 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A0A0B4J203 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
A0A0B4J203 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A0A0B4J203 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A0A0B4J203 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A0A0B4J203 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A0A0B4J203 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A0A0B4J203 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
A0A0B4J203 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A0A0B4J203 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
A0A0B4J203 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
A0A0B4J203 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
A0A0B4J203 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
A0A0B4J203 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
A0A0B4J203 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
A0A0B4J203 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
A0A0B4J203 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
A0A0B4J203 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
A0A0B4J203 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
A0A0B4J203 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
A0A0B4J203 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
A0A0B4J203 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms