Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SNX12Q9UMY4 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SNX12Q9UMY4 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms