Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB5

MBD2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD2Q9UBB5 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MBD2Q9UBB5 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms