Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 ZNF185-209ENST00000449285 4328 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.377e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 LMO7-204ENST00000377499 3472 ntTSL 212.72□□□□□ -0.377e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 MPP7-202ENST00000375719 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.377e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 DHX38-204ENST00000563819 706 ntTSL 312.69□□□□□ -0.387e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 AP4M1-212ENST00000450807 548 ntTSL 312.69□□□□□ -0.387e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 C14orf159-202ENST00000298858 642 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.387e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 ACOT11-202ENST00000371316 6369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.387e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 PFDN5-208ENST00000549995 598 ntTSL 312.64□□□□□ -0.399e-15■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 CCDC180-202ENST00000471314 614 ntTSL 312.63□□□□□ -0.397e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 LRP5L-208ENST00000610821 3602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.399e-15■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 EEA1-201ENST00000322349 9875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.397e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 RHD-210ENST00000622561 3007 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.397e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 VPS52-213ENST00000461743 547 ntTSL 312.58□□□□□ -0.47e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 SEPT9-239ENST00000591704 749 ntTSL 212.56□□□□□ -0.47e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 DGKZ-209ENST00000525242 542 ntTSL 412.55□□□□□ -0.41e-21■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 AP1S2-202ENST00000380291 3492 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.47e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 EHD2-201ENST00000263277 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.47e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 AAGAB-201ENST00000261880 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.41e-15■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 MED6-202ENST00000430055 1507 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.417e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 POLR2C-208ENST00000567982 1135 ntTSL 212.5□□□□□ -0.417e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 PRKCZ-211ENST00000470986 706 ntTSL 212.49□□□□□ -0.417e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 PCAT18-201ENST00000579458 2598 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.417e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 KANK2-211ENST00000592215 417 ntTSL 312.48□□□□□ -0.417e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 LGALS8-219ENST00000526589 6420 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.411e-6■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 C14orf159-222ENST00000522170 853 ntTSL 312.46□□□□□ -0.417e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 TXNL4B-201ENST00000268483 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.427e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 LRP5L-204ENST00000467672 3605 ntTSL 1 (best)12.42□□□□□ -0.429e-15■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 XRRA1-203ENST00000431210 2995 ntTSL 212.41□□□□□ -0.429e-15■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 THEMIS2-211ENST00000492877 2861 ntTSL 212.33□□□□□ -0.447e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 MVB12A-205ENST00000528604 656 ntTSL 312.33□□□□□ -0.447e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 FAM13B-202ENST00000420893 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.447e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 OTUD7B-202ENST00000581312 8872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.447e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 TEX14-202ENST00000349033 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.447e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 RHD-201ENST00000328664 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.457e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 U3.49-201ENST00000391065 214 ntBASIC12.25□□□□□ -0.457e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 NADSYN1-211ENST00000527963 479 ntTSL 412.25□□□□□ -0.457e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 C22orf46-201ENST00000402966 4975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.457e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 CDADC1-205ENST00000496061 688 ntTSL 1 (best)12.19□□□□□ -0.469e-15■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 AL354993.2-201ENST00000558738 542 ntTSL 4 BASIC12.16□□□□□ -0.467e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 POLR2C-202ENST00000562599 748 ntTSL 512.15□□□□□ -0.467e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 ZNF674-205ENST00000521626 576 ntTSL 412.15□□□□□ -0.467e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 RAD18-209ENST00000473069 556 ntTSL 412.13□□□□□ -0.479e-15■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 SPOCD1-207ENST00000485944 2879 ntTSL 212.12□□□□□ -0.477e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 C10orf128-202ENST00000374151 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.477e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 ARMC1-201ENST00000276569 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.487e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 PRKCQ-202ENST00000397176 3096 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.487e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 NCK1-AS1-202ENST00000470236 612 ntTSL 312.07□□□□□ -0.485e-11■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 CHIC1-203ENST00000498318 2800 ntTSL 212.06□□□□□ -0.487e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 CCDC85C-205ENST00000556348 556 ntTSL 512.06□□□□□ -0.487e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 EARS2-203ENST00000562402 580 ntTSL 312.02□□□□□ -0.497e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 PIGH-212ENST00000561303 593 ntTSL 312.01□□□□□ -0.497e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 C14orf159-208ENST00000517877 591 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.497e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 C14orf159-206ENST00000517362 583 ntTSL 412□□□□□ -0.497e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 CERCAM-211ENST00000487001 553 ntTSL 511.99□□□□□ -0.497e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 MAEA-214ENST00000510862 486 ntTSL 311.94□□□□□ -0.59e-15■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 FGL1-204ENST00000398056 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.57e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 PIGF-203ENST00000412717 737 ntTSL 311.91□□□□□ -0.57e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 POU6F1-201ENST00000333640 2960 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.57e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 SKA2-206ENST00000581068 595 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.517e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 SKA2-204ENST00000578519 894 ntTSL 311.88□□□□□ -0.517e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 AC011997.1-201ENST00000409845 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.517e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 COL6A3-201ENST00000295550 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.517e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 SP4-204ENST00000448246 4293 ntTSL 511.85□□□□□ -0.517e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 EFL1-202ENST00000359445 3470 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.527e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 PFDN5-212ENST00000550880 595 ntTSL 211.75□□□□□ -0.539e-15■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 SIGLEC1-202ENST00000419548 4326 ntTSL 211.74□□□□□ -0.537e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 CNR2-201ENST00000374472 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.537e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 CHKB-CPT1B-202ENST00000453634 2816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.537e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 SELENBP1-209ENST00000455397 1521 ntTSL 511.73□□□□□ -0.537e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 LINC00689-204ENST00000447563 3824 ntTSL 1 (best)11.72□□□□□ -0.537e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 PFDN5-216ENST00000552341 1980 ntTSL 211.72□□□□□ -0.539e-15■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 BACE1-AS-201ENST00000614401 520 ntTSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.549e-15■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 GIGYF2-228ENST00000469843 550 ntTSL 411.65□□□□□ -0.549e-15■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 ZNF814-203ENST00000594629 570 ntTSL 511.65□□□□□ -0.547e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 LGALS8-212ENST00000450372 6281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.551e-6■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 MLX-204ENST00000585403 1068 ntTSL 1 (best)11.64□□□□□ -0.557e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 STRADA-239ENST00000639778 477 ntTSL 311.64□□□□□ -0.553e-17■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 ZNF185-211ENST00000535861 4421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.557e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 PTPRM-205ENST00000577827 4640 ntTSL 211.63□□□□□ -0.557e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 GAD1-202ENST00000358196 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.557e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 SECISBP2-203ENST00000425851 826 ntTSL 311.62□□□□□ -0.559e-15■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 SPOCD1-202ENST00000360482 3960 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.557e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 COL6A3-205ENST00000392004 4037 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.557e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 AC022098.1-203ENST00000592086 449 ntTSL 311.6□□□□□ -0.557e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 SETX-202ENST00000436441 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 511.6□□□□□ -0.559e-15■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 FP325330.3-201ENST00000623760 9537 ntBASIC11.59□□□□□ -0.557e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 QTRT2-209ENST00000479882 1196 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.567e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 RHD-205ENST00000423253 951 ntTSL 511.56□□□□□ -0.567e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 GAS8-216ENST00000568664 341 ntTSL 511.54□□□□□ -0.564e-9■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 GAS8-209ENST00000564802 470 ntTSL 311.51□□□□□ -0.577e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 NLRP2-205ENST00000397169 550 ntTSL 411.5□□□□□ -0.577e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 ZFYVE19-204ENST00000560078 2913 ntTSL 211.49□□□□□ -0.577e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 ZMAT3-202ENST00000414084 743 ntTSL 411.48□□□□□ -0.577e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 FGL1-201ENST00000381840 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.577e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 SPOCD1-214ENST00000533231 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.577e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 PFDN5-210ENST00000550513 939 ntTSL 311.45□□□□□ -0.589e-15■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 AC040977.2-201ENST00000572547 498 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.584e-9■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 CDADC1-203ENST00000466868 677 ntTSL 1 (best)11.37□□□□□ -0.599e-15■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 TXNL4B-202ENST00000423037 2490 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.37□□□□□ -0.597e-8■■■■■ 186.3
UTP3Q9NQZ2 AP001258.1-202ENST00000531708 880 ntTSL 511.36□□□□□ -0.597e-8■■■■■ 186.3
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