Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP85

NPHS2, Podocin, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHS2Q9NP85 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NPHS2Q9NP85 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NPHS2Q9NP85 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NPHS2Q9NP85 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NPHS2Q9NP85 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NPHS2Q9NP85 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NPHS2Q9NP85 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NPHS2Q9NP85 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NPHS2Q9NP85 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NPHS2Q9NP85 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NPHS2Q9NP85 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NPHS2Q9NP85 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NPHS2Q9NP85 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NPHS2Q9NP85 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NPHS2Q9NP85 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NPHS2Q9NP85 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NPHS2Q9NP85 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NPHS2Q9NP85 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NPHS2Q9NP85 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NPHS2Q9NP85 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NPHS2Q9NP85 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NPHS2Q9NP85 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NPHS2Q9NP85 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NPHS2Q9NP85 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NPHS2Q9NP85 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NPHS2Q9NP85 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NPHS2Q9NP85 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NPHS2Q9NP85 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NPHS2Q9NP85 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NPHS2Q9NP85 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NPHS2Q9NP85 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NPHS2Q9NP85 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NPHS2Q9NP85 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NPHS2Q9NP85 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NPHS2Q9NP85 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NPHS2Q9NP85 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NPHS2Q9NP85 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NPHS2Q9NP85 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NPHS2Q9NP85 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NPHS2Q9NP85 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NPHS2Q9NP85 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NPHS2Q9NP85 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NPHS2Q9NP85 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NPHS2Q9NP85 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NPHS2Q9NP85 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NPHS2Q9NP85 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NPHS2Q9NP85 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NPHS2Q9NP85 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NPHS2Q9NP85 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NPHS2Q9NP85 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NPHS2Q9NP85 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NPHS2Q9NP85 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NPHS2Q9NP85 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NPHS2Q9NP85 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NPHS2Q9NP85 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NPHS2Q9NP85 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NPHS2Q9NP85 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NPHS2Q9NP85 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NPHS2Q9NP85 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NPHS2Q9NP85 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NPHS2Q9NP85 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NPHS2Q9NP85 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NPHS2Q9NP85 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NPHS2Q9NP85 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NPHS2Q9NP85 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NPHS2Q9NP85 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NPHS2Q9NP85 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NPHS2Q9NP85 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NPHS2Q9NP85 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NPHS2Q9NP85 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NPHS2Q9NP85 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NPHS2Q9NP85 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NPHS2Q9NP85 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NPHS2Q9NP85 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NPHS2Q9NP85 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NPHS2Q9NP85 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NPHS2Q9NP85 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NPHS2Q9NP85 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NPHS2Q9NP85 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NPHS2Q9NP85 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NPHS2Q9NP85 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NPHS2Q9NP85 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NPHS2Q9NP85 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NPHS2Q9NP85 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NPHS2Q9NP85 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NPHS2Q9NP85 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NPHS2Q9NP85 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NPHS2Q9NP85 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NPHS2Q9NP85 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NPHS2Q9NP85 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NPHS2Q9NP85 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NPHS2Q9NP85 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NPHS2Q9NP85 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NPHS2Q9NP85 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NPHS2Q9NP85 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NPHS2Q9NP85 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NPHS2Q9NP85 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NPHS2Q9NP85 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NPHS2Q9NP85 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NPHS2Q9NP85 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms