Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT88

SYT11, Synaptotagmin-11, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT11Q9BT88 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYT11Q9BT88 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYT11Q9BT88 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYT11Q9BT88 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SYT11Q9BT88 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYT11Q9BT88 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SYT11Q9BT88 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYT11Q9BT88 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYT11Q9BT88 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYT11Q9BT88 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYT11Q9BT88 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYT11Q9BT88 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYT11Q9BT88 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYT11Q9BT88 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYT11Q9BT88 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYT11Q9BT88 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYT11Q9BT88 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYT11Q9BT88 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYT11Q9BT88 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYT11Q9BT88 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYT11Q9BT88 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYT11Q9BT88 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYT11Q9BT88 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SYT11Q9BT88 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYT11Q9BT88 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SYT11Q9BT88 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SYT11Q9BT88 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYT11Q9BT88 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYT11Q9BT88 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYT11Q9BT88 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYT11Q9BT88 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYT11Q9BT88 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYT11Q9BT88 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYT11Q9BT88 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYT11Q9BT88 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYT11Q9BT88 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYT11Q9BT88 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYT11Q9BT88 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYT11Q9BT88 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYT11Q9BT88 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYT11Q9BT88 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYT11Q9BT88 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYT11Q9BT88 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYT11Q9BT88 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYT11Q9BT88 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYT11Q9BT88 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYT11Q9BT88 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYT11Q9BT88 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYT11Q9BT88 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SYT11Q9BT88 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYT11Q9BT88 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SYT11Q9BT88 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SYT11Q9BT88 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SYT11Q9BT88 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYT11Q9BT88 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYT11Q9BT88 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYT11Q9BT88 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYT11Q9BT88 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYT11Q9BT88 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYT11Q9BT88 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYT11Q9BT88 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYT11Q9BT88 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYT11Q9BT88 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYT11Q9BT88 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYT11Q9BT88 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYT11Q9BT88 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYT11Q9BT88 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYT11Q9BT88 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYT11Q9BT88 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYT11Q9BT88 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYT11Q9BT88 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYT11Q9BT88 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYT11Q9BT88 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYT11Q9BT88 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYT11Q9BT88 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYT11Q9BT88 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYT11Q9BT88 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYT11Q9BT88 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYT11Q9BT88 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYT11Q9BT88 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYT11Q9BT88 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYT11Q9BT88 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYT11Q9BT88 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYT11Q9BT88 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYT11Q9BT88 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYT11Q9BT88 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYT11Q9BT88 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYT11Q9BT88 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYT11Q9BT88 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYT11Q9BT88 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYT11Q9BT88 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYT11Q9BT88 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYT11Q9BT88 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYT11Q9BT88 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYT11Q9BT88 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYT11Q9BT88 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYT11Q9BT88 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYT11Q9BT88 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYT11Q9BT88 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYT11Q9BT88 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms