Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EBF4Q9BQW3 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms