Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TWIST1Q15672 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TWIST1Q15672 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TWIST1Q15672 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TWIST1Q15672 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TWIST1Q15672 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TWIST1Q15672 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TWIST1Q15672 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TWIST1Q15672 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TWIST1Q15672 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TWIST1Q15672 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TWIST1Q15672 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TWIST1Q15672 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TWIST1Q15672 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TWIST1Q15672 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TWIST1Q15672 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TWIST1Q15672 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TWIST1Q15672 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TWIST1Q15672 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TWIST1Q15672 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TWIST1Q15672 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TWIST1Q15672 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TWIST1Q15672 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TWIST1Q15672 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TWIST1Q15672 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TWIST1Q15672 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TWIST1Q15672 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TWIST1Q15672 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TWIST1Q15672 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TWIST1Q15672 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TWIST1Q15672 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TWIST1Q15672 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TWIST1Q15672 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TWIST1Q15672 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TWIST1Q15672 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TWIST1Q15672 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TWIST1Q15672 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TWIST1Q15672 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TWIST1Q15672 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TWIST1Q15672 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TWIST1Q15672 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TWIST1Q15672 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TWIST1Q15672 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TWIST1Q15672 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TWIST1Q15672 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TWIST1Q15672 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TWIST1Q15672 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TWIST1Q15672 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TWIST1Q15672 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TWIST1Q15672 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TWIST1Q15672 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TWIST1Q15672 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TWIST1Q15672 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TWIST1Q15672 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TWIST1Q15672 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TWIST1Q15672 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TWIST1Q15672 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TWIST1Q15672 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TWIST1Q15672 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TWIST1Q15672 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TWIST1Q15672 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TWIST1Q15672 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TWIST1Q15672 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TWIST1Q15672 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TWIST1Q15672 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TWIST1Q15672 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TWIST1Q15672 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TWIST1Q15672 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TWIST1Q15672 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TWIST1Q15672 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TWIST1Q15672 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TWIST1Q15672 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TWIST1Q15672 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TWIST1Q15672 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TWIST1Q15672 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TWIST1Q15672 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
TWIST1Q15672 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
TWIST1Q15672 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TWIST1Q15672 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TWIST1Q15672 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TWIST1Q15672 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TWIST1Q15672 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TWIST1Q15672 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TWIST1Q15672 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TWIST1Q15672 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TWIST1Q15672 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TWIST1Q15672 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TWIST1Q15672 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TWIST1Q15672 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
TWIST1Q15672 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
TWIST1Q15672 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TWIST1Q15672 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TWIST1Q15672 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TWIST1Q15672 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TWIST1Q15672 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
TWIST1Q15672 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TWIST1Q15672 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TWIST1Q15672 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TWIST1Q15672 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
TWIST1Q15672 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms